Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms