Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms