Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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