Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms