Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACER1Q8TDN7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms