Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms