Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms