Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms