Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL3Q8N8U3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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