Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms