Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms