Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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