Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms