Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms