Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms