Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP50Q70EL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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