Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZVL8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms