Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms