Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms