Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms