Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms