Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms