Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms