Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms