Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms