Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms