Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms