Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms