Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms