Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms