Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms