Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf46Q504U0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms