Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC57Q2TAC2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC57Q2TAC2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms