Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPHKAPQ2M3C7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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