Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms