Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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