Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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