Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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