Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ZNF56Q15929 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF56Q15929 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF56Q15929 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF56Q15929 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF56Q15929 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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