Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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