Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA1Q15788 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA1Q15788 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA1Q15788 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA1Q15788 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA1Q15788 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA1Q15788 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA1Q15788 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA1Q15788 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA1Q15788 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
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NCOA1Q15788 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA1Q15788 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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NCOA1Q15788 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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NCOA1Q15788 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.53■■■□□ 2
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NCOA1Q15788 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA1Q15788 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA1Q15788 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA1Q15788 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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