Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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SF3A1Q15459 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A1Q15459 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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