Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARHGEF6Q15052 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGEF6Q15052 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms