Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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