Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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