Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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