Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRP1BQ14684 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms