Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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