Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms