Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE1CQ14123 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms